A metodologia da CPT Bahia, refletida nas práticas de seus agentes em relação à realidade e à sua missão, se caracteriza pela inserção nos meios populares.
Em primeiro lugar, tentar ouvir e conhecer as motivações mais profundas das ações e reações que os/as camponesas/as vivem em suas realidades desafiadoras.
Com a continuidade sistemática de um irrenunciável trabalho de base, refletido, planejado e avaliado, a CPT Bahia visa prestar um serviço formativo e informativo que amplie a compreensão sobre qualquer tipo de realidade e de perspectivas para a mesma.
Objetiva, também, contribuir para uma tomada de posição e de organização autônoma e planejada em vista de objetivos coletivamente construídos e assumidos.
Assim, a CPT Bahia procura encontrar um equilíbrio entre as dimensões sócio-econômicas, políticas e de presença solidária junto aos pobres do campo e às problemáticas por eles vividas, valorizando a eficácia de seu protagonismo.